chirurgie, biologie
Biosciences

Bases Algorithmiques et Statistiques de l’Analyse des Séquences – Applications avec les logiciels disponibles en ligne

L’analyse des séquences des macromolécules est un des aspects fondamentaux de la génomique actuelle. Ce stage permet de s’y former d’un point de vue théorique et pratique.

OBJECTIFS ET COMPÉTENCES VISÉES

  • Le stagiaire comprendra les méthodes et les algorithmes utilisés en génomique et en analyse de séquences.
  • Il se familiarisera avec l’utilisation des outils bioinformatiques disponibles en ligne.
  • L’accent sera mis sur l’utilisation raisonnée des logiciels afin d’amener le stagiaire à avoir une analyse critique des résultats.

CONTENU DU PROGRAMME

  • Alignements 2 à 2 (NWS, Smith&Waterman).
  • Alignement globaux, alignements par blocs.
  • Scores d’alignements.
  • Validation statistique.
  • Banque de données.
  • Algorithmes de recherche de similarités dans les banques (algorithmes de FASTA, BLAST, SSEARCH).
  • Détermination des motifs – recherche de motifs sur les séquences ou sur les banques – Application à la localisation de zones codantes.

PÉDAGOGIE, MÉTHODE ET OUTILS

  • Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).
  • Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.

LES POINTS FORTS DE LA FORMATION

  • Formation conçue en cohérence avec les besoins identifiés sur le marché du travail
  • Méthode pédagogique orientée vers l’acquisition d’outils stratégiques et opérationnels efficaces, complets, pertinents et innovants
  • Corps professoral composé d’enseignants-chercheurs et auteurs de renommée internationale

Catégorie de l’action de développement des compétences:

(Article L6313-1 du Code du Travail)

Action de formation

Thématique : Bioinformatique

Responsable(s) pédagogique(s) :

Ingrid LAFONTAINE

Philippe LOPEZ

Organisation et Durée :4 Jours consécutifs

Effectifs : Min 1 pers. / Max 4 pers.

Tarifs :

1 100 € (Sorbonne université est exonérée de TVA au titre de l’article 261-4-4° du code général des impôts)

Lieu :

Campus Pierre et Marie Curie- Paris (Jussieu)

Calendrier : Du 06 au 09 avril 2021 – Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.

Public : Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens.

Pré-requis :

Connaissances de base en biologie moléculaire. Habitude du travail sur ordinateur et de l’utilisation d’Internet.

Documents : Supports de cours PDF

Évaluation et validation : Attestation de fin de formation et de compétences

Possibilité de sessions sur-mesure

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